Esta iglesia ha adquirido un estatus religioso especial entre las iglesias coptas porque está asociada con el viaje de la Sagrada Familia a Egipto.
Según una narración bíblica del evangelista Mateo (Capítulo 2), la Virgen María, José y el niño Jesús huyeron de Palestina a Egipto por temor a la persecución del rey judío Herodes el Grande. La Sagrada Familia viajó hasta Assiut (“Deir el Muharraq”) y de regreso a casa pasó algunas semanas en El Cairo Viejo.
La iglesia se ha quemado y ha sido restaurada varias veces a lo largo de los siglos, sufriendo su primera conflagración en 750. Fue restaurada por última vez en 2000.
La iglesia de San Sergio y San Baco, Abu Sarga, está dedicado a los dos santos Sergio y Baco que sirvieron como soldados en el ejército romano. Eran fieles seguidores de Jesús y se negaron a adorar a los dioses romanos. Por su fe cristiana, Sergio y Baco finalmente sufrieron el martirio en Siria en 296 durante el reinado del emperador romano Maximino. Sus reliquias se guardan en parte en Abu Sarga y otras están enterradas en Siria.
Desde el siglo IX al XII, se eligieron importantes patriarcas y se consagraron varios obispos en Abu Sarga hasta el siglo XI. Aunque la iglesia fue restaurada varias veces (siglos XI y XVII, la última restauración se realizó en 2000), aún conserva su encanto medieval.
Iglesia de San Sergio y San Baco o Abu Sarga se basa en una estructura basilicana con una nave y dos pasillos laterales. El extremo oeste de la iglesia está ocupado por un pasillo de retorno. Doce columnas se colocan entre la nave y los pasillos, once de las cuales son de mármol blanco y solo una es de granito rojo. Algunas de las columnas de mármol muestran rastros claros de figuras que probablemente representan a santos. Entre los fustes de las columnas y los arquitrabes de madera se colocan capiteles corintios procedentes de construcciones más antiguas.
En el lado este de la iglesia, un santuario tripartito está separado de la sala de congregación por un impresionante biombo de madera bellamente decorado con ébano y marfil y cuya parte más antigua data del siglo XIII. Iconos excepcionales con varias escenas de la vida de Cristo, la Virgen María y diversos santos adornan las paredes de Abu Sarga.
En el interior de su santuario principal se coloca una marquesina de madera sostenida por cuatro pilares sobre el altar y pintada con escenas bíblicas, entre las que se encuentran Jesús Pantocrátor y el Arcángel Gabriel apareciendo a la Virgen María. El ábside detrás del altar está ricamente decorado con tiras de mármol y mosaicos. Un asiento administrativo está incorporado en el ábside y se puede llegar a él por siete escalones.
Abu Sarga una vez conservó el altar más antiguo de Egipto que fue transferido al Museo Copto. El techo es una de las características más interesantes de la iglesia y se dice que fue construido con la forma del arca de Noé.
En el lado noroeste de la iglesia hay un baptisterio. El ambón de mármol es una copia moderna del de la iglesia vecina de Santa Bárbara. Partes del púlpito de madera original se llevaron al Museo Copto y también al Museo Británico de Londres. Sobre los pasillos laterales y de retorno hay una galería con dos capillas (una dedicada a Sergio y Baco, la otra a Ibraham, Isaac y Jacob) que se utilizan para el servicio privado y durante el ayuno de Pascua.